Do podstawowych zadań Biura Głównego Inspektora należy:

1. koordynowanie współpracy Głównego Inspektora z Ministerstwem Zdrowia, Sejmem i Senatem RP, organami administracji rządowej, organami samorządu terytorialnego, związkami zawodowymi oraz organizacjami pozarządowymi;
    
2. realizowanie zadań bezpośredniej obsługi Głównego Inspektora;
    
3. planowanie pracy i realizowanie zadań wynikających z obsługi Kolegium Głównego Inspektora;
    
4. koordynowanie spotkań i narad Głównego Inspektora i jego zastępców we współpracy z innymi komórkami organizacyjnymi;
    
5. prowadzenie terminarza wyjazdów Głównego Inspektora i jego zastępców oraz organizacja tych wyjazdów;
    
6. prowadzenie rejestru zaproszeń dla Głównego Inspektora;
    
7. monitorowanie terminowej realizacji decyzji i poleceń Głównego Inspektora;
    
8. koordynowanie przygotowywania materiałów przedstawianych przez Głównego Inspektora na posiedzenia Kolegium Ministerstwa Zdrowia i nadzór nad realizacją ustaleń z tych posiedzeń;
    
9. prowadzenie rejestru dokumentów rządowych nie mających charakteru aktów prawnych;
    
10. zapewnienie obsługi kancelaryjnej w zakresie korespondencji przychodzącej i wychodzącej z Głównego Inspektoratu;
     
11. przyjmowanie i rejestracja skarg i wniosków i kierowanie ich do właściwych merytorycznie komórek organizacyjnych i monitorowanie sposobu ich załatwienia;
     
12. przedkładanie do podpisu Głównemu Inspektorowi dokumentów i pism zastrzeżonych do jego wyłącznej kompetencji;
     
13. prowadzenie spraw związanych z przyznawaniem odznaczeń państwowych i resortowych
    
14. koordynowanie działań dotyczących współpracy ze środkami masowego przekazu i promowanie wizerunku Państwowej Inspekcji Sanitarnej w mediach i prasie;
     
15. przygotowywanie w porozumieniu z innymi komórkami organizacyjnymi materiałów na konferencje prasowe, organizacja konferencji prasowych, telekonferencji i briefingów ;
     
16. prowadzenie rejestru korespondencji kierowanej bezpośrednio do Głównego Inspektora oraz monitorowanie sposobu jej załatwienia;
     
17. prowadzenie spraw osobowych państwowych wojewódzkich inspektorów sanitarnych i zastępców państwowych wojewódzkich inspektorów sanitarnych w zakresie określonym właściwymi przepisami prawa;
     
18. nadzór nad wdrożonym systemem jednolitych form kontroli oraz przebiegiem wdrażania Systemu Zarządzania Jakością i akredytacją w Państwowej Inspekcji Sanitarnej;
     
19. opracowywanie rozwiązań doskonalących funkcjonowanie Systemu Zarządzania Jakością w Państwowej Inspekcji Sanitarnej;
     
20. współpraca z jednostkami ustawowo zajmującymi się akredytacją i certyfikacją;
     
21. współpraca z Ministerstwem Spraw Wewnętrznych i Administracji w zakresie zadań realizowanych przez Zespół Zagospodarowania Granicy Państwowej;
     
22. prowadzenie spraw związanych z ochroną informacji niejawnych.